• CSS Log In
  • Language
  • Transcriptome Sequencing
  • Eukaryote
  • mRNA Sequencing
  • Non-coding RNA Sequencing
  • Long Non-coding RNA Sequencing
  • Small RNA Sequencing
  • Circular RNA Sequencing
  • Whole Transcriptome Sequencing
  • Isoform Sequencing (Full-length Transcript Sequencing)
  • Prokaryote
  • Prokaryotic RNA Sequencing
  • Metatranscriptome Sequencing
  • Epigenomics
  • Whole Genome Bisulfite Sequencing (Gene Methylation)
  • Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS-Gene Methylation)
  • ChIP-Seq
  • RIP-Seq
  • Metagenomics
  • 16S/18S/ITS Amplicon Metagenomic Sequencing
  • Metagenomic Sequencing
  • Pre-made Library Sequencing
  • Pre-made Library Sequencing
  • Clinical Diagnostics
  • CLIA/CAP Whole Exome Sequencing
  • Clinical Panels
  • Genetic Testing
  • Oncology
  • NovoPM™ 2.0
  • NovoFocus™ NSCLC 2.0
  • NovoFocus™ CRC 2.0
  • NovoFocus™ PARPi CDx 1.0
  • NovoFocus™ CR
  • Cancer Immunotherapy Biomarkers
  • Patient's Case Study
  • Service Support
  • Service Workflow
  • Sample Preparation Guide
  • Sample Requirements
  • Quality Management
  • Data Analysis
  • FAQs​​
  • Technology
  • Overview
  • Platform
  • Certification
  • Intelligent Delivery Platform
  • Resources
  • Publications
  • Downloads
  • Webinars
  • About
  • About Us
  • Major Milestones
  • News & Events
  • Careers
  • Contact Us
  • De novo Sequencing
  • Animal & Plant De novo Sequencing
  • Microbial Denovo Sequencing
  • Transcriptome Sequencing

  • Whole Transcriptome Sequencing
  • Isoform Sequencing (Full-length Transcript Sequencing)
  • Prokaryote
  • Prokaryotic RNA Sequencing
  • Metatranscriptome Sequencing
  • Epigenomics

    Metagenomics

    Pre-made Library Sequencing

  • Overview
  • Platform
  • Certification
  • Intelligent Delivery Platform
  • Publications
  • Downloads
  • Webinars
  • About Us
  • Major Milestones
  • News & Events
  • Careers
  • お問い合わせは こちら
    皆様の研究の ニーズに関して お気軽にご相談ください
    Research Services

    Mouse Whole Exome Sequencing

    概要

    全エクソームシーケンス(WES)を使用すると、ゲノムのコード領域を選択的にシーケンスすることで、疾患や表現型に影響を与える可能性が最も高い遺伝子のみを解析することができます。 マウスであるMus musculusは、人間の病気の研究や創薬のための重要なモデル生物です。 Novogeneのマウス全エクソームシーケンス(mWES)によって、表現型を持つマウスの原因となる変異を特定できます。これは、ヒトの疾患遺伝子の発見につながる可能性があります。

    Service Specifications

    アプリケーション

  • 医薬品開発
  • 人間の健康と病気のモデル研究
  • Novogeneの強み

  • 最先端のNGSテクノロジー:Novogeneは、IlluminaのHiSeqやNovaSeq 6000システムなど、世界でも最先端のテクノロジーを使用した世界最大規模のシーケンスサービスプロバイダーです。
  • 最高のデータ品質:Q30スコアは80%以上を保証します。これはIlluminaの公式保証である75%以上です。 データ例をご覧ください。
  • 並外れたインフォマティクスの専門知識:Novogeneは最先端のバイオインフォマティクスパイプラインと、国際的に認められた最高クラスのソフトウェアを使用して、信頼性が高く、論文にすぐに使用できるデータをお客様に提供します。
  • サンプル要件

    Sample Type
    Amount (Qubit®)
    Purity
    Genomic DNA
    ≥400 ng
    OD260/280=1.8-2.0;
    Genomic DNA from FFPE *
    ≥0.8 μg

    シーケンスパラメーターと解析内容

    プラットフォーム
    Illumina Novaseq 6000
    読み取り長
    ペアエンド150
    推奨されるシーケンス深度
    >50× (6G)
    標準データ解析
    データ品質管理
    アライメント、シーケンス深度、カバレッジの統計解析
    SNP、InDelの検出、アノテーション、統計解析
    ソマティック SNP/InDel/CNVの検出、アノテーション、統計解析 (腫瘍検体一対)

    注:詳細については、サービス仕様をご参照ください。カスタマイズされたリクエストについては、お問い合わせください

    プロジェクトワークフロー


    Sequencing error rate distribution


    Note: The x-axis represents position in reads, and the y-axis represents the average error rate of bases of all reads at a position.


    GC content distribution


    Note: The x-axis is position in reads, and the y-axis is percentage of each type of bases (A, T, G, C); different bases are distinguishable by different colors.


    Sequencing depth & coverage distribution


    Note: Average sequencing depth (bar plot) and coverage (dot-line plot) in each chromosome. The x-axis represents chromosome; the left y-axis is the average depth; the right y-axis is the coverage (proportion of covered bases).


    SNP detection

    Sample
    Sample_1
    Sample_2
    Sample_3
    Sample_4
    Sample_5
    CDS
    22849
    22726
    22681
    22679
    22496
    Synonymous SNP
    11491
    11441
    11416
    11,408.00
    11532
    missense SNP
    10697
    10657
    10,628.00
    10639
    10359
    stopgain
    91
    87
    87
    87
    79
    stoploss
    12
    12
    12
    13
    15
    unknown
    564
    535
    544
    536
    520
    itronic
    130230
    128685
    129046
    132820
    182248
    UTR3
    6431
    6217
    6301
    6413
    7612
    UTR5
    3177
    3150
    3163
    3234
    3730
    splicing
    81
    81
    81
    81
    76
    ncRNA exonic
    3328
    3289
    3312
    3343
    4037
    ncRNA intronic
    11066
    10967
    10946
    11426
    17658
    ncRNA splicing
    8
    10
    13
    13
    13
    upstream
    4488
    4204
    4270
    4458
    6344
    downstream
    2392
    2352
    2436
    2406
    3501
    intergenic
    66631
    64399
    64589
    68470
    137307
    Total
    250922
    246335
    247081
    255588
    385335

    Heatmap of significantly mutated genes